Kilka tysięcy lat temu mieszkańcy Atlantydy stworzyli kwitnącą cywilizację. Atlantyda była u szczytu swej potęgi, kiedy król i jego poddani postanowili użyć swych niezwykłych mocy do przejęcia władzy nad światem. Wybuchł otwarty konflikt, który doprowadził do zagłady miasta. Zmieciona z powierzchni ziemi Atlantyda zniknęła bez śladu i wszelki słuch o niej zaginął. Aż do teraz...
Rok 1914. Milo James Thatch, młody kartograf i lingwista, bezskutecznie stara się przekonać kolegów z muzeum, w którym pracuje, że wie, gdzie znajduje się legendarna Atlantyda. Jego nieżyjący już dziadek, Thaddeus Thatch, opowiedział mu o tajemniczym "dzienniku Shepherda", starożytnej księdze, która zawiera klucz do odnalezienia zaginionego lądu. Nikt nie daje wiary słowom Milo...
W chwili, gdy Milo traci nadzieję, iż kiedykolwiek wyruszy na poszukiwanie Atlantydy, wezwany zostaje do domu ekscentrycznego multimilionera, Prestona B. Whitmore'a, gdzie na własne oczy po raz pierwszy